Carlo Pongetti è professore ordinario di Geografia nell'Università di Macerata, afferisce al Dipartimento di Studi Umanistici che ha diretto dal 2015 al 2021.

In precedenza è stato professore associato di Geografia sociale nell'Università di Perugia e ricercatore presso l'Università di Urbino.

Ha ricoperto la carica di Fiduciario per le Marche della Società Geografia Italiana e di Segretario nazionale dell'Associazione dei Geografi Italiani (Agei). Dal 2002 al 2018 è stato Presidente dell'Accademia Georgica di Treia e dal 2019 al 2021 Presidente della Deputazione di Storia patria per le Marche.

La sua attività di ricerca privilegia la Geografia dei rapporti città-campagna, lo studio del bacino Adriatico, delle migrazioni del passato e delle attuali. Si è dedicato a ricerche di geografia storica e storia della cartografia.

Ha al suo attivo 150 pubblicazioni tra volumi, curatele, articoli e note. Tra i vari volumi ha curato: La Macroregione Adriatico-Ionica. Valori culturali e dinamiche territoriali tra le due sponde dell'Adriatico, Ancona, Assemblea Legislativa delle Marche, 2015 e, più recentemente, il volume Dissesto idrogeologico e vulnerabilità territoriale nelle Marche. Indagini di lungo periodo, Fermo, Andrea Livi, 2024.